学校成立农业工程学部(以下简称学部),负责统筹组织农业工程一流学科等工作。学部隶属于ATY.COM爱体育(中国大陆)科技公司党委。
学部现设有精准感知、低碳驱动、智能装备、智慧农场、农机智库5大研究方向,17个学部研究团队,团队双聘人员270人左右,积极开展有组织科研,推动实现农业工程领域关键技术突破、重大装备研制等。
2024年,学校“智慧农业技术与装备学科交叉中心”入选首批江苏高校学科交叉中心(试点)建设项目。中心面向我国智慧农业和智能农机现代化发展面临的重大科学问题和关键瓶颈技术,打造农、工、理、管等多学科交叉团队和科研平台,重构育人育才和创新成果培育体系,大力推进学科交叉人才培养、技术创新、平台建设,为学校“双一流”创建和特色鲜明高水平大学建设提供重要支撑力量。